Пробовал создать отсутствующий xorg.conf с соответствующей записью об устройстве, мониторе, режиме и виртуальном разрешении - в результате даже в консоль не удавалось выйти - иногда случайно получалось, а в основном экран ни на что не реагировал. Удалил файл, стало так, как было: некоторые окна не влезают в экран. Кажется, нужно добавить что-то свое в /etc/X11/xorg.conf.d, но что именно?
X -configure cp
X -configure
cp ~/xorg.conf.new /etc/X11/xorg.conf
reboot