guitarix

Признаться честно, немного путанно изъясняетесь. Что касается настройки джэка в вики всё более чем подробно расписано -- реалтайм ядро(есть в оверлее про-аудио), права для запуска джэка в реалтайм-режиме. Зависит от железа, я запускаю джэк так:

jackd -Rv -p512 -d alsa -dhw:1 -r96000 -p4096 -n2

А точнее, при помощи малость переписанного под себя sys-apps/jackd-init -- нравится, когда джэк при загрузке системы стартует.
Подключать каналы в джэке просто:

~ ► jack_lsp                              13:32 Пнд 2010-08-23 kami31@l4n732nu5
system:capture_1
system:capture_2
system:playback_1
system:playback_2
moc:output0
moc:output1
alsa-jack.jackP.21079.1:out_000
alsa-jack.jackP.21079.1:out_001
~ ► jack_connect moc:output1 system:playback_1

Хотя предпочитаю использовать GUI в виде media-sound/patchage (для тех, чьему сердцу ближе кутэ есть media-sound/qjackctl).
Что касается звуковых карт -- это лучше вам на оф.сайте альсы глянуть -- там должен быть список поддерживаемых.
А, да, ещё, для сохранения сессий подключений джэка есть media-sound/lash -- рекомендую его поставить и включить его юзы. Но с ним я пока особо не разобрался -- нужды не возникало. И ещё рекомендация -- собирать джэк по-новее, можно даже из гита -- версии 0.* имеют тенденцию сегфолтится при внезапном завершении работы аудио-приложений, что довольно неприятно.